2009年，在学校党委和上级团组织的正确领导下，我校基层团组织深入贯彻落实科学发展观，围绕学校、直属附属医院中心工作，依托亚运盛会为契机，不断深化青年文明号、青年岗位能手活动，涌现出了一大批品德优良、技能精湛、锐意创新、成果突出的先进集体和优秀青年人才。

　　在2009年度团市委青年文明号、青年岗位能手评比中，我校第二附属医院神经内科一区被授予“2009年度广州市青年文明号标兵示范岗”；第一附属医院胸外科负压病房、第一附属医院体检中心、第三附属医院新生儿科被命名为“2009年度广州市青年文明号”；第一附属医院吴文起同志获得“2009年度广州市十大杰出青年岗位能手”称号；附属肿瘤医院方盛华、第三附属医院熊明媚同志获得2009年度“广州市青年岗位能手”荣誉称号；共青团广州医学院委员会荣获“2009年度广州市青年文明号创建活动优秀组织奖”。

　　截止目前，我校已创建国家级“青年文明号”1个，省级“青年文明号”3个，市级“青年文明号”29个。